Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9BO43861 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms