Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LANCL1O43813 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms