Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR1O43759 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms