Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATCO43716 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATCO43716 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATCO43716 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GATCO43716 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATCO43716 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATCO43716 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATCO43716 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATCO43716 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATCO43716 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATCO43716 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATCO43716 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATCO43716 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATCO43716 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATCO43716 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATCO43716 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms