Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN6O43657 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms