Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHMP2AO43633 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP2AO43633 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMP2AO43633 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMP2AO43633 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMP2AO43633 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP2AO43633 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP2AO43633 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP2AO43633 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms