Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATMINO43313 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATMINO43313 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATMINO43313 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATMINO43313 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATMINO43313 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATMINO43313 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATMINO43313 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATMINO43313 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATMINO43313 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMINO43313 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMINO43313 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMINO43313 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMINO43313 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMINO43313 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMINO43313 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMINO43313 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMINO43313 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMINO43313 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMINO43313 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMINO43313 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMINO43313 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMINO43313 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMINO43313 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMINO43313 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMINO43313 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATMINO43313 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATMINO43313 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATMINO43313 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATMINO43313 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATMINO43313 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATMINO43313 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATMINO43313 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATMINO43313 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATMINO43313 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATMINO43313 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATMINO43313 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATMINO43313 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATMINO43313 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATMINO43313 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATMINO43313 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATMINO43313 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATMINO43313 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATMINO43313 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATMINO43313 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATMINO43313 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATMINO43313 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATMINO43313 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATMINO43313 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATMINO43313 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATMINO43313 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATMINO43313 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATMINO43313 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATMINO43313 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATMINO43313 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATMINO43313 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATMINO43313 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATMINO43313 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATMINO43313 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMINO43313 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMINO43313 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMINO43313 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMINO43313 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMINO43313 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMINO43313 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMINO43313 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMINO43313 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMINO43313 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMINO43313 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMINO43313 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMINO43313 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMINO43313 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMINO43313 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATMINO43313 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATMINO43313 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATMINO43313 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATMINO43313 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATMINO43313 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATMINO43313 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATMINO43313 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATMINO43313 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATMINO43313 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATMINO43313 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATMINO43313 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATMINO43313 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATMINO43313 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATMINO43313 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATMINO43313 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATMINO43313 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATMINO43313 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATMINO43313 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATMINO43313 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATMINO43313 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATMINO43313 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATMINO43313 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATMINO43313 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATMINO43313 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATMINO43313 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATMINO43313 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATMINO43313 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms