Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GPAA1O43292 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GPAA1O43292 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms