Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRODHO43272 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRODHO43272 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRODHO43272 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRODHO43272 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRODHO43272 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRODHO43272 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRODHO43272 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PRODHO43272 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRODHO43272 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRODHO43272 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRODHO43272 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRODHO43272 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRODHO43272 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRODHO43272 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRODHO43272 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRODHO43272 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRODHO43272 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRODHO43272 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRODHO43272 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRODHO43272 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRODHO43272 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRODHO43272 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRODHO43272 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PRODHO43272 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRODHO43272 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRODHO43272 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRODHO43272 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRODHO43272 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRODHO43272 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRODHO43272 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRODHO43272 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRODHO43272 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRODHO43272 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRODHO43272 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRODHO43272 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRODHO43272 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRODHO43272 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRODHO43272 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRODHO43272 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRODHO43272 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRODHO43272 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRODHO43272 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRODHO43272 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRODHO43272 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRODHO43272 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRODHO43272 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRODHO43272 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRODHO43272 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRODHO43272 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRODHO43272 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRODHO43272 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRODHO43272 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRODHO43272 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRODHO43272 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRODHO43272 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRODHO43272 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRODHO43272 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRODHO43272 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRODHO43272 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRODHO43272 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRODHO43272 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRODHO43272 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRODHO43272 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRODHO43272 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRODHO43272 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRODHO43272 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRODHO43272 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms