Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF1O43189 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF1O43189 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF1O43189 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF1O43189 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF1O43189 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF1O43189 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF1O43189 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF1O43189 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF1O43189 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF1O43189 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF1O43189 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF1O43189 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF1O43189 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF1O43189 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF1O43189 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF1O43189 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF1O43189 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF1O43189 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF1O43189 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF1O43189 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF1O43189 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF1O43189 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF1O43189 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF1O43189 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF1O43189 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF1O43189 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF1O43189 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF1O43189 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF1O43189 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF1O43189 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF1O43189 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF1O43189 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF1O43189 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF1O43189 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF1O43189 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF1O43189 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF1O43189 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF1O43189 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF1O43189 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF1O43189 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF1O43189 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF1O43189 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF1O43189 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF1O43189 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF1O43189 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF1O43189 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF1O43189 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF1O43189 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF1O43189 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF1O43189 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF1O43189 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF1O43189 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF1O43189 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF1O43189 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PHF1O43189 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PHF1O43189 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PHF1O43189 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PHF1O43189 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PHF1O43189 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PHF1O43189 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PHF1O43189 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF1O43189 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF1O43189 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF1O43189 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF1O43189 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF1O43189 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF1O43189 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF1O43189 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF1O43189 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF1O43189 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF1O43189 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF1O43189 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF1O43189 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF1O43189 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF1O43189 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF1O43189 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF1O43189 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF1O43189 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF1O43189 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF1O43189 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF1O43189 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms