Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP26A1O43174 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP26A1O43174 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms