Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms