Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBDO15205 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBDO15205 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBDO15205 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBDO15205 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBDO15205 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBDO15205 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBDO15205 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBDO15205 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBDO15205 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBDO15205 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBDO15205 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBDO15205 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBDO15205 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBDO15205 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBDO15205 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBDO15205 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UBDO15205 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBDO15205 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBDO15205 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBDO15205 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBDO15205 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBDO15205 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBDO15205 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBDO15205 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBDO15205 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBDO15205 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBDO15205 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBDO15205 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBDO15205 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBDO15205 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBDO15205 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBDO15205 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBDO15205 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBDO15205 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBDO15205 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBDO15205 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBDO15205 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBDO15205 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBDO15205 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBDO15205 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBDO15205 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBDO15205 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBDO15205 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBDO15205 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBDO15205 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBDO15205 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBDO15205 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBDO15205 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBDO15205 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBDO15205 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBDO15205 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBDO15205 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBDO15205 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBDO15205 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBDO15205 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBDO15205 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBDO15205 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBDO15205 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBDO15205 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBDO15205 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBDO15205 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBDO15205 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBDO15205 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBDO15205 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBDO15205 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBDO15205 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBDO15205 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBDO15205 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBDO15205 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBDO15205 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBDO15205 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBDO15205 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBDO15205 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBDO15205 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBDO15205 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBDO15205 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBDO15205 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBDO15205 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBDO15205 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBDO15205 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBDO15205 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBDO15205 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBDO15205 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBDO15205 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBDO15205 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBDO15205 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBDO15205 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBDO15205 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBDO15205 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBDO15205 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBDO15205 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBDO15205 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBDO15205 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBDO15205 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
UBDO15205 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBDO15205 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBDO15205 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBDO15205 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBDO15205 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms