Protein–RNA interactions for Protein: O15119

TBX3, T-box transcription factor TBX3, humanhuman

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX3O15119 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX3O15119 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX3O15119 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX3O15119 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX3O15119 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX3O15119 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX3O15119 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX3O15119 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX3O15119 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX3O15119 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX3O15119 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX3O15119 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX3O15119 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX3O15119 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX3O15119 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX3O15119 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX3O15119 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX3O15119 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX3O15119 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX3O15119 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX3O15119 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX3O15119 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX3O15119 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX3O15119 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX3O15119 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX3O15119 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX3O15119 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX3O15119 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX3O15119 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX3O15119 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX3O15119 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX3O15119 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX3O15119 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX3O15119 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX3O15119 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX3O15119 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX3O15119 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX3O15119 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX3O15119 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX3O15119 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TBX3O15119 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX3O15119 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX3O15119 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX3O15119 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX3O15119 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX3O15119 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX3O15119 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX3O15119 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX3O15119 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX3O15119 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX3O15119 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX3O15119 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX3O15119 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX3O15119 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX3O15119 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX3O15119 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX3O15119 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX3O15119 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX3O15119 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX3O15119 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX3O15119 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX3O15119 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX3O15119 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX3O15119 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX3O15119 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX3O15119 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX3O15119 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX3O15119 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX3O15119 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX3O15119 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX3O15119 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX3O15119 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX3O15119 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX3O15119 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX3O15119 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX3O15119 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX3O15119 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX3O15119 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX3O15119 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX3O15119 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX3O15119 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX3O15119 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX3O15119 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX3O15119 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX3O15119 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX3O15119 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX3O15119 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX3O15119 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX3O15119 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX3O15119 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX3O15119 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX3O15119 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX3O15119 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX3O15119 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX3O15119 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX3O15119 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX3O15119 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBX3O15119 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBX3O15119 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBX3O15119 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms