Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3EO15041 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms