Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLR3AO14802 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLR3AO14802 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLR3AO14802 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLR3AO14802 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLR3AO14802 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLR3AO14802 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
POLR3AO14802 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLR3AO14802 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
POLR3AO14802 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR3AO14802 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR3AO14802 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms