Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ELL2O00472 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ELL2O00472 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ELL2O00472 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ELL2O00472 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ELL2O00472 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ELL2O00472 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ELL2O00472 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ELL2O00472 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ELL2O00472 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ELL2O00472 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ELL2O00472 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ELL2O00472 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ELL2O00472 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ELL2O00472 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ELL2O00472 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ELL2O00472 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ELL2O00472 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ELL2O00472 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ELL2O00472 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ELL2O00472 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ELL2O00472 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ELL2O00472 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ELL2O00472 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ELL2O00472 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ELL2O00472 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ELL2O00472 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ELL2O00472 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ELL2O00472 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ELL2O00472 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ELL2O00472 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ELL2O00472 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ELL2O00472 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ELL2O00472 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ELL2O00472 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ELL2O00472 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ELL2O00472 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ELL2O00472 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ELL2O00472 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELL2O00472 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELL2O00472 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELL2O00472 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELL2O00472 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELL2O00472 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELL2O00472 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ELL2O00472 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELL2O00472 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELL2O00472 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ELL2O00472 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELL2O00472 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ELL2O00472 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ELL2O00472 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ELL2O00472 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ELL2O00472 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ELL2O00472 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ELL2O00472 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ELL2O00472 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ELL2O00472 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ELL2O00472 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ELL2O00472 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ELL2O00472 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ELL2O00472 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ELL2O00472 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ELL2O00472 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ELL2O00472 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ELL2O00472 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ELL2O00472 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ELL2O00472 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ELL2O00472 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ELL2O00472 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ELL2O00472 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ELL2O00472 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ELL2O00472 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ELL2O00472 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ELL2O00472 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ELL2O00472 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ELL2O00472 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ELL2O00472 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ELL2O00472 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ELL2O00472 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ELL2O00472 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ELL2O00472 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ELL2O00472 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ELL2O00472 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ELL2O00472 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ELL2O00472 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ELL2O00472 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ELL2O00472 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ELL2O00472 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ELL2O00472 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ELL2O00472 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ELL2O00472 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ELL2O00472 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ELL2O00472 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ELL2O00472 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ELL2O00472 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ELL2O00472 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ELL2O00472 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ELL2O00472 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ELL2O00472 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms