Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC7O00311 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC7O00311 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC7O00311 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC7O00311 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC7O00311 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC7O00311 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC7O00311 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDC7O00311 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC7O00311 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC7O00311 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC7O00311 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC7O00311 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC7O00311 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC7O00311 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC7O00311 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC7O00311 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC7O00311 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC7O00311 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC7O00311 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC7O00311 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC7O00311 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC7O00311 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC7O00311 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC7O00311 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC7O00311 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC7O00311 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC7O00311 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC7O00311 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC7O00311 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC7O00311 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC7O00311 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC7O00311 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC7O00311 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC7O00311 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC7O00311 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC7O00311 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC7O00311 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC7O00311 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC7O00311 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC7O00311 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC7O00311 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC7O00311 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC7O00311 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC7O00311 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC7O00311 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC7O00311 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC7O00311 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC7O00311 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC7O00311 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC7O00311 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC7O00311 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC7O00311 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC7O00311 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC7O00311 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC7O00311 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC7O00311 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC7O00311 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC7O00311 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC7O00311 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC7O00311 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC7O00311 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC7O00311 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC7O00311 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC7O00311 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC7O00311 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC7O00311 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC7O00311 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC7O00311 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC7O00311 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC7O00311 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC7O00311 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC7O00311 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC7O00311 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC7O00311 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC7O00311 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC7O00311 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC7O00311 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC7O00311 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC7O00311 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC7O00311 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC7O00311 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC7O00311 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC7O00311 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC7O00311 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC7O00311 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC7O00311 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC7O00311 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC7O00311 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC7O00311 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC7O00311 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC7O00311 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC7O00311 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC7O00311 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC7O00311 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC7O00311 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC7O00311 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC7O00311 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC7O00311 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC7O00311 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms