Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3FO00303 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms