Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DFFAO00273 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DFFAO00273 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DFFAO00273 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DFFAO00273 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DFFAO00273 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DFFAO00273 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DFFAO00273 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DFFAO00273 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DFFAO00273 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DFFAO00273 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DFFAO00273 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DFFAO00273 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DFFAO00273 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DFFAO00273 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DFFAO00273 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DFFAO00273 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DFFAO00273 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DFFAO00273 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DFFAO00273 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DFFAO00273 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DFFAO00273 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DFFAO00273 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DFFAO00273 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DFFAO00273 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DFFAO00273 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DFFAO00273 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DFFAO00273 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DFFAO00273 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DFFAO00273 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DFFAO00273 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DFFAO00273 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DFFAO00273 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DFFAO00273 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DFFAO00273 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DFFAO00273 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DFFAO00273 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DFFAO00273 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DFFAO00273 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DFFAO00273 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DFFAO00273 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DFFAO00273 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DFFAO00273 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DFFAO00273 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DFFAO00273 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DFFAO00273 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DFFAO00273 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DFFAO00273 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DFFAO00273 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DFFAO00273 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DFFAO00273 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DFFAO00273 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DFFAO00273 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DFFAO00273 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DFFAO00273 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DFFAO00273 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DFFAO00273 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DFFAO00273 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DFFAO00273 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DFFAO00273 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DFFAO00273 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DFFAO00273 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DFFAO00273 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DFFAO00273 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DFFAO00273 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DFFAO00273 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DFFAO00273 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DFFAO00273 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DFFAO00273 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DFFAO00273 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DFFAO00273 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DFFAO00273 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DFFAO00273 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DFFAO00273 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DFFAO00273 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DFFAO00273 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DFFAO00273 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DFFAO00273 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DFFAO00273 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DFFAO00273 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DFFAO00273 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DFFAO00273 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DFFAO00273 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DFFAO00273 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DFFAO00273 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DFFAO00273 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DFFAO00273 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DFFAO00273 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DFFAO00273 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DFFAO00273 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DFFAO00273 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DFFAO00273 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DFFAO00273 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DFFAO00273 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DFFAO00273 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DFFAO00273 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DFFAO00273 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DFFAO00273 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DFFAO00273 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DFFAO00273 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms