Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10AO00220 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF10AO00220 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF10AO00220 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms