Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAPO00193 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAPO00193 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAPO00193 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAPO00193 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAPO00193 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAPO00193 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAPO00193 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAPO00193 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAPO00193 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAPO00193 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAPO00193 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAPO00193 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAPO00193 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAPO00193 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAPO00193 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAPO00193 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAPO00193 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAPO00193 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAPO00193 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAPO00193 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAPO00193 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAPO00193 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAPO00193 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAPO00193 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAPO00193 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAPO00193 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAPO00193 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAPO00193 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAPO00193 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAPO00193 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAPO00193 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAPO00193 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAPO00193 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAPO00193 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAPO00193 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAPO00193 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAPO00193 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAPO00193 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAPO00193 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAPO00193 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAPO00193 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAPO00193 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAPO00193 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAPO00193 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMAPO00193 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMAPO00193 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAPO00193 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAPO00193 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAPO00193 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAPO00193 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAPO00193 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAPO00193 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAPO00193 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAPO00193 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAPO00193 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAPO00193 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAPO00193 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAPO00193 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAPO00193 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAPO00193 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAPO00193 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAPO00193 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAPO00193 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAPO00193 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAPO00193 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAPO00193 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAPO00193 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAPO00193 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAPO00193 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAPO00193 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAPO00193 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAPO00193 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAPO00193 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAPO00193 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAPO00193 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAPO00193 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAPO00193 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAPO00193 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAPO00193 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAPO00193 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAPO00193 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAPO00193 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAPO00193 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAPO00193 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAPO00193 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAPO00193 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAPO00193 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAPO00193 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAPO00193 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAPO00193 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAPO00193 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAPO00193 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAPO00193 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAPO00193 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAPO00193 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAPO00193 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAPO00193 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAPO00193 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAPO00193 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms