Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms