Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
I3L3M4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
I3L3M4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
I3L3M4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
I3L3M4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
I3L3M4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
I3L3M4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
I3L3M4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
I3L3M4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
I3L3M4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
I3L3M4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
I3L3M4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
I3L3M4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
I3L3M4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
I3L3M4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
I3L3M4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
I3L3M4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
I3L3M4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
I3L3M4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
I3L3M4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
I3L3M4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
I3L3M4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
I3L3M4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
I3L3M4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
I3L3M4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
I3L3M4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
I3L3M4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
I3L3M4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
I3L3M4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
I3L3M4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
I3L3M4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
I3L3M4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
I3L3M4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
I3L3M4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
I3L3M4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
I3L3M4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
I3L3M4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
I3L3M4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
I3L3M4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
I3L3M4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
I3L3M4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
I3L3M4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
I3L3M4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
I3L3M4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
I3L3M4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
I3L3M4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
I3L3M4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
I3L3M4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
I3L3M4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
I3L3M4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
I3L3M4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
I3L3M4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms