Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BM21 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BM21 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BM21 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BM21 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BM21 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BM21 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BM21 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BM21 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BM21 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BM21 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BM21 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BM21 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BM21 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BM21 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BM21 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BM21 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BM21 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BM21 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BM21 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BM21 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BM21 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BM21 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BM21 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BM21 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BM21 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BM21 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BM21 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BM21 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BM21 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BM21 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BM21 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BM21 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BM21 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BM21 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BM21 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BM21 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BM21 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BM21 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BM21 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BM21 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BM21 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BM21 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BM21 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BM21 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BM21 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BM21 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BM21 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BM21 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BM21 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BM21 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BM21 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BM21 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BM21 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BM21 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BM21 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BM21 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BM21 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BM21 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BM21 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BM21 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BM21 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BM21 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BM21 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BM21 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BM21 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BM21 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BM21 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BM21 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
H3BM21 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
H3BM21 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
H3BM21 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BM21 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BM21 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BM21 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BM21 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BM21 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BM21 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BM21 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BM21 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BM21 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BM21 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BM21 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BM21 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BM21 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BM21 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BM21 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms