Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E5RI56 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E5RI56 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E5RI56 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E5RI56 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E5RI56 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E5RI56 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E5RI56 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E5RI56 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E5RI56 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
E5RI56 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E5RI56 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E5RI56 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E5RI56 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E5RI56 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E5RI56 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E5RI56 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E5RI56 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E5RI56 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E5RI56 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E5RI56 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E5RI56 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E5RI56 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E5RI56 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E5RI56 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E5RI56 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E5RI56 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E5RI56 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E5RI56 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E5RI56 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E5RI56 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E5RI56 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E5RI56 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E5RI56 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E5RI56 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E5RI56 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E5RI56 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E5RI56 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E5RI56 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
E5RI56 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E5RI56 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E5RI56 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
E5RI56 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E5RI56 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E5RI56 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E5RI56 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E5RI56 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E5RI56 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E5RI56 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E5RI56 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E5RI56 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E5RI56 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E5RI56 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E5RI56 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E5RI56 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E5RI56 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E5RI56 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E5RI56 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E5RI56 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E5RI56 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E5RI56 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E5RI56 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
E5RI56 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E5RI56 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E5RI56 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E5RI56 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E5RI56 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E5RI56 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E5RI56 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E5RI56 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E5RI56 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
E5RI56 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E5RI56 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E5RI56 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E5RI56 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E5RI56 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E5RI56 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E5RI56 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E5RI56 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
E5RI56 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
E5RI56 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E5RI56 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E5RI56 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
E5RI56 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
E5RI56 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
E5RI56 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
E5RI56 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E5RI56 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E5RI56 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E5RI56 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E5RI56 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E5RI56 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E5RI56 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E5RI56 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E5RI56 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E5RI56 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E5RI56 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
E5RI56 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E5RI56 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E5RI56 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms