Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms