Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DEV8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DEV8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DEV8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DEV8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DEV8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DEV8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DEV8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DEV8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DEV8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DEV8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DEV8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DEV8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DEV8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DEV8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DEV8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DEV8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DEV8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DEV8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DEV8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DEV8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DEV8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DEV8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DEV8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DEV8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DEV8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DEV8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DEV8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DEV8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DEV8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DEV8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DEV8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DEV8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DEV8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DEV8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DEV8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DEV8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DEV8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DEV8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DEV8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DEV8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DEV8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DEV8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DEV8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DEV8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DEV8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DEV8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DEV8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DEV8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DEV8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DEV8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DEV8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DEV8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DEV8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DEV8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DEV8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DEV8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms