Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PP2D1A8MPX8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PP2D1A8MPX8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms