Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms