Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms