Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM72A0PK05 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms