Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQD8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PQD8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
A0A1W2PQD8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
A0A1W2PQD8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PQD8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PQD8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PQD8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PQD8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PQD8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PQD8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PQD8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PQD8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms