Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms