Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRKBQ9Y3C4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRKBQ9Y3C4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPRKBQ9Y3C4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPRKBQ9Y3C4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPRKBQ9Y3C4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRKBQ9Y3C4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRKBQ9Y3C4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPRKBQ9Y3C4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TPRKBQ9Y3C4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPRKBQ9Y3C4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRKBQ9Y3C4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRKBQ9Y3C4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPRKBQ9Y3C4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPRKBQ9Y3C4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRKBQ9Y3C4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRKBQ9Y3C4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRKBQ9Y3C4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRKBQ9Y3C4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPRKBQ9Y3C4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRKBQ9Y3C4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRKBQ9Y3C4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRKBQ9Y3C4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRKBQ9Y3C4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRKBQ9Y3C4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRKBQ9Y3C4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRKBQ9Y3C4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRKBQ9Y3C4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRKBQ9Y3C4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRKBQ9Y3C4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRKBQ9Y3C4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRKBQ9Y3C4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRKBQ9Y3C4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRKBQ9Y3C4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPRKBQ9Y3C4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPRKBQ9Y3C4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPRKBQ9Y3C4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPRKBQ9Y3C4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPRKBQ9Y3C4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRKBQ9Y3C4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRKBQ9Y3C4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TPRKBQ9Y3C4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPRKBQ9Y3C4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRKBQ9Y3C4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRKBQ9Y3C4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRKBQ9Y3C4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRKBQ9Y3C4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPRKBQ9Y3C4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPRKBQ9Y3C4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRKBQ9Y3C4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRKBQ9Y3C4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRKBQ9Y3C4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPRKBQ9Y3C4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRKBQ9Y3C4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPRKBQ9Y3C4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPRKBQ9Y3C4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRKBQ9Y3C4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRKBQ9Y3C4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPRKBQ9Y3C4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPRKBQ9Y3C4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPRKBQ9Y3C4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRKBQ9Y3C4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPRKBQ9Y3C4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRKBQ9Y3C4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRKBQ9Y3C4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRKBQ9Y3C4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRKBQ9Y3C4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRKBQ9Y3C4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRKBQ9Y3C4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRKBQ9Y3C4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRKBQ9Y3C4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRKBQ9Y3C4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRKBQ9Y3C4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPRKBQ9Y3C4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPRKBQ9Y3C4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPRKBQ9Y3C4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPRKBQ9Y3C4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TPRKBQ9Y3C4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPRKBQ9Y3C4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPRKBQ9Y3C4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPRKBQ9Y3C4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPRKBQ9Y3C4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPRKBQ9Y3C4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TPRKBQ9Y3C4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPRKBQ9Y3C4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPRKBQ9Y3C4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPRKBQ9Y3C4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRKBQ9Y3C4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRKBQ9Y3C4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPRKBQ9Y3C4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPRKBQ9Y3C4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRKBQ9Y3C4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPRKBQ9Y3C4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPRKBQ9Y3C4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPRKBQ9Y3C4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRKBQ9Y3C4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRKBQ9Y3C4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms