Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN2A-AS1Q9UH64 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDKN2A-AS1Q9UH64 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN2A-AS1Q9UH64 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN2A-AS1Q9UH64 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDKN2A-AS1Q9UH64 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN2A-AS1Q9UH64 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN2A-AS1Q9UH64 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN2A-AS1Q9UH64 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN2A-AS1Q9UH64 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN2A-AS1Q9UH64 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN2A-AS1Q9UH64 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN2A-AS1Q9UH64 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN2A-AS1Q9UH64 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN2A-AS1Q9UH64 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN2A-AS1Q9UH64 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN2A-AS1Q9UH64 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN2A-AS1Q9UH64 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN2A-AS1Q9UH64 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN2A-AS1Q9UH64 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN2A-AS1Q9UH64 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN2A-AS1Q9UH64 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN2A-AS1Q9UH64 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN2A-AS1Q9UH64 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN2A-AS1Q9UH64 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN2A-AS1Q9UH64 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN2A-AS1Q9UH64 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN2A-AS1Q9UH64 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN2A-AS1Q9UH64 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN2A-AS1Q9UH64 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CDKN2A-AS1Q9UH64 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN2A-AS1Q9UH64 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN2A-AS1Q9UH64 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN2A-AS1Q9UH64 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN2A-AS1Q9UH64 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN2A-AS1Q9UH64 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN2A-AS1Q9UH64 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN2A-AS1Q9UH64 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN2A-AS1Q9UH64 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN2A-AS1Q9UH64 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN2A-AS1Q9UH64 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN2A-AS1Q9UH64 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN2A-AS1Q9UH64 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN2A-AS1Q9UH64 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN2A-AS1Q9UH64 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN2A-AS1Q9UH64 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN2A-AS1Q9UH64 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN2A-AS1Q9UH64 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN2A-AS1Q9UH64 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN2A-AS1Q9UH64 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN2A-AS1Q9UH64 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN2A-AS1Q9UH64 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN2A-AS1Q9UH64 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN2A-AS1Q9UH64 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms