Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MTRF1LQ9UGC7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTRF1LQ9UGC7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTRF1LQ9UGC7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTRF1LQ9UGC7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MTRF1LQ9UGC7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MTRF1LQ9UGC7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTRF1LQ9UGC7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTRF1LQ9UGC7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTRF1LQ9UGC7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTRF1LQ9UGC7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTRF1LQ9UGC7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTRF1LQ9UGC7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTRF1LQ9UGC7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTRF1LQ9UGC7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTRF1LQ9UGC7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTRF1LQ9UGC7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTRF1LQ9UGC7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTRF1LQ9UGC7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTRF1LQ9UGC7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTRF1LQ9UGC7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTRF1LQ9UGC7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MTRF1LQ9UGC7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTRF1LQ9UGC7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTRF1LQ9UGC7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MTRF1LQ9UGC7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTRF1LQ9UGC7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTRF1LQ9UGC7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTRF1LQ9UGC7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTRF1LQ9UGC7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTRF1LQ9UGC7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTRF1LQ9UGC7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTRF1LQ9UGC7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTRF1LQ9UGC7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTRF1LQ9UGC7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MTRF1LQ9UGC7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTRF1LQ9UGC7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTRF1LQ9UGC7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTRF1LQ9UGC7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTRF1LQ9UGC7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTRF1LQ9UGC7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTRF1LQ9UGC7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTRF1LQ9UGC7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MTRF1LQ9UGC7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTRF1LQ9UGC7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTRF1LQ9UGC7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTRF1LQ9UGC7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTRF1LQ9UGC7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTRF1LQ9UGC7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTRF1LQ9UGC7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTRF1LQ9UGC7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTRF1LQ9UGC7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTRF1LQ9UGC7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTRF1LQ9UGC7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTRF1LQ9UGC7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTRF1LQ9UGC7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTRF1LQ9UGC7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTRF1LQ9UGC7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTRF1LQ9UGC7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTRF1LQ9UGC7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTRF1LQ9UGC7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTRF1LQ9UGC7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTRF1LQ9UGC7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTRF1LQ9UGC7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTRF1LQ9UGC7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTRF1LQ9UGC7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTRF1LQ9UGC7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTRF1LQ9UGC7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTRF1LQ9UGC7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTRF1LQ9UGC7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTRF1LQ9UGC7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTRF1LQ9UGC7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTRF1LQ9UGC7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MTRF1LQ9UGC7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTRF1LQ9UGC7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTRF1LQ9UGC7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTRF1LQ9UGC7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTRF1LQ9UGC7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTRF1LQ9UGC7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTRF1LQ9UGC7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTRF1LQ9UGC7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTRF1LQ9UGC7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTRF1LQ9UGC7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTRF1LQ9UGC7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTRF1LQ9UGC7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTRF1LQ9UGC7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTRF1LQ9UGC7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTRF1LQ9UGC7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTRF1LQ9UGC7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTRF1LQ9UGC7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTRF1LQ9UGC7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTRF1LQ9UGC7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTRF1LQ9UGC7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTRF1LQ9UGC7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTRF1LQ9UGC7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTRF1LQ9UGC7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTRF1LQ9UGC7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTRF1LQ9UGC7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTRF1LQ9UGC7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTRF1LQ9UGC7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms