Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC9

OTOR, Otoraplin, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTORQ9NRC9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTORQ9NRC9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTORQ9NRC9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTORQ9NRC9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTORQ9NRC9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTORQ9NRC9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTORQ9NRC9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTORQ9NRC9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTORQ9NRC9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTORQ9NRC9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTORQ9NRC9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
OTORQ9NRC9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTORQ9NRC9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTORQ9NRC9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTORQ9NRC9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTORQ9NRC9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTORQ9NRC9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTORQ9NRC9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTORQ9NRC9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTORQ9NRC9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTORQ9NRC9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTORQ9NRC9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTORQ9NRC9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTORQ9NRC9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTORQ9NRC9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTORQ9NRC9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTORQ9NRC9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTORQ9NRC9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTORQ9NRC9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTORQ9NRC9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTORQ9NRC9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTORQ9NRC9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
OTORQ9NRC9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTORQ9NRC9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTORQ9NRC9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTORQ9NRC9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTORQ9NRC9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTORQ9NRC9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTORQ9NRC9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTORQ9NRC9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTORQ9NRC9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTORQ9NRC9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTORQ9NRC9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTORQ9NRC9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTORQ9NRC9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTORQ9NRC9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTORQ9NRC9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTORQ9NRC9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTORQ9NRC9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTORQ9NRC9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTORQ9NRC9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTORQ9NRC9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTORQ9NRC9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTORQ9NRC9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTORQ9NRC9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OTORQ9NRC9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTORQ9NRC9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTORQ9NRC9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTORQ9NRC9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTORQ9NRC9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTORQ9NRC9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTORQ9NRC9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
OTORQ9NRC9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTORQ9NRC9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTORQ9NRC9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTORQ9NRC9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTORQ9NRC9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTORQ9NRC9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTORQ9NRC9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OTORQ9NRC9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTORQ9NRC9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTORQ9NRC9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTORQ9NRC9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTORQ9NRC9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTORQ9NRC9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTORQ9NRC9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTORQ9NRC9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTORQ9NRC9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTORQ9NRC9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTORQ9NRC9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTORQ9NRC9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTORQ9NRC9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTORQ9NRC9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms