Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BIN3Q9NQY0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BIN3Q9NQY0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BIN3Q9NQY0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIN3Q9NQY0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BIN3Q9NQY0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BIN3Q9NQY0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BIN3Q9NQY0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BIN3Q9NQY0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIN3Q9NQY0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIN3Q9NQY0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIN3Q9NQY0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIN3Q9NQY0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIN3Q9NQY0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIN3Q9NQY0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIN3Q9NQY0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIN3Q9NQY0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIN3Q9NQY0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIN3Q9NQY0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIN3Q9NQY0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIN3Q9NQY0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIN3Q9NQY0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIN3Q9NQY0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIN3Q9NQY0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIN3Q9NQY0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIN3Q9NQY0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIN3Q9NQY0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIN3Q9NQY0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BIN3Q9NQY0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIN3Q9NQY0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIN3Q9NQY0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIN3Q9NQY0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BIN3Q9NQY0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIN3Q9NQY0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIN3Q9NQY0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIN3Q9NQY0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BIN3Q9NQY0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BIN3Q9NQY0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIN3Q9NQY0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIN3Q9NQY0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIN3Q9NQY0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIN3Q9NQY0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BIN3Q9NQY0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIN3Q9NQY0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIN3Q9NQY0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIN3Q9NQY0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIN3Q9NQY0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BIN3Q9NQY0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BIN3Q9NQY0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIN3Q9NQY0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIN3Q9NQY0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIN3Q9NQY0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIN3Q9NQY0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIN3Q9NQY0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIN3Q9NQY0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIN3Q9NQY0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIN3Q9NQY0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIN3Q9NQY0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIN3Q9NQY0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIN3Q9NQY0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIN3Q9NQY0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIN3Q9NQY0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIN3Q9NQY0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIN3Q9NQY0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIN3Q9NQY0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BIN3Q9NQY0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BIN3Q9NQY0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BIN3Q9NQY0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BIN3Q9NQY0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIN3Q9NQY0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIN3Q9NQY0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIN3Q9NQY0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIN3Q9NQY0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIN3Q9NQY0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIN3Q9NQY0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BIN3Q9NQY0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIN3Q9NQY0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIN3Q9NQY0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BIN3Q9NQY0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BIN3Q9NQY0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BIN3Q9NQY0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BIN3Q9NQY0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BIN3Q9NQY0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BIN3Q9NQY0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BIN3Q9NQY0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BIN3Q9NQY0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BIN3Q9NQY0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BIN3Q9NQY0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BIN3Q9NQY0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BIN3Q9NQY0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BIN3Q9NQY0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BIN3Q9NQY0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BIN3Q9NQY0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BIN3Q9NQY0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BIN3Q9NQY0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BIN3Q9NQY0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BIN3Q9NQY0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BIN3Q9NQY0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BIN3Q9NQY0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BIN3Q9NQY0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms