Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNB1IP1Q9NPC3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNB1IP1Q9NPC3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNB1IP1Q9NPC3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNB1IP1Q9NPC3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNB1IP1Q9NPC3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNB1IP1Q9NPC3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNB1IP1Q9NPC3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNB1IP1Q9NPC3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNB1IP1Q9NPC3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNB1IP1Q9NPC3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNB1IP1Q9NPC3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNB1IP1Q9NPC3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNB1IP1Q9NPC3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNB1IP1Q9NPC3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNB1IP1Q9NPC3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNB1IP1Q9NPC3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNB1IP1Q9NPC3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNB1IP1Q9NPC3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNB1IP1Q9NPC3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNB1IP1Q9NPC3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNB1IP1Q9NPC3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNB1IP1Q9NPC3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNB1IP1Q9NPC3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNB1IP1Q9NPC3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNB1IP1Q9NPC3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNB1IP1Q9NPC3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNB1IP1Q9NPC3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNB1IP1Q9NPC3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNB1IP1Q9NPC3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNB1IP1Q9NPC3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNB1IP1Q9NPC3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNB1IP1Q9NPC3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNB1IP1Q9NPC3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNB1IP1Q9NPC3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNB1IP1Q9NPC3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNB1IP1Q9NPC3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNB1IP1Q9NPC3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNB1IP1Q9NPC3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNB1IP1Q9NPC3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNB1IP1Q9NPC3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNB1IP1Q9NPC3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNB1IP1Q9NPC3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNB1IP1Q9NPC3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNB1IP1Q9NPC3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNB1IP1Q9NPC3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNB1IP1Q9NPC3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNB1IP1Q9NPC3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNB1IP1Q9NPC3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNB1IP1Q9NPC3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNB1IP1Q9NPC3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNB1IP1Q9NPC3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNB1IP1Q9NPC3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNB1IP1Q9NPC3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNB1IP1Q9NPC3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNB1IP1Q9NPC3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNB1IP1Q9NPC3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNB1IP1Q9NPC3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNB1IP1Q9NPC3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNB1IP1Q9NPC3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNB1IP1Q9NPC3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNB1IP1Q9NPC3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNB1IP1Q9NPC3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNB1IP1Q9NPC3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNB1IP1Q9NPC3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNB1IP1Q9NPC3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNB1IP1Q9NPC3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNB1IP1Q9NPC3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNB1IP1Q9NPC3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNB1IP1Q9NPC3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNB1IP1Q9NPC3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNB1IP1Q9NPC3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNB1IP1Q9NPC3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNB1IP1Q9NPC3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNB1IP1Q9NPC3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNB1IP1Q9NPC3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNB1IP1Q9NPC3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNB1IP1Q9NPC3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNB1IP1Q9NPC3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNB1IP1Q9NPC3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms