Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMURF1Q9HCE7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMURF1Q9HCE7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMURF1Q9HCE7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMURF1Q9HCE7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMURF1Q9HCE7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMURF1Q9HCE7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMURF1Q9HCE7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMURF1Q9HCE7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMURF1Q9HCE7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMURF1Q9HCE7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMURF1Q9HCE7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMURF1Q9HCE7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMURF1Q9HCE7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMURF1Q9HCE7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMURF1Q9HCE7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMURF1Q9HCE7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMURF1Q9HCE7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMURF1Q9HCE7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMURF1Q9HCE7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMURF1Q9HCE7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMURF1Q9HCE7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMURF1Q9HCE7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMURF1Q9HCE7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMURF1Q9HCE7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMURF1Q9HCE7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMURF1Q9HCE7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMURF1Q9HCE7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMURF1Q9HCE7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMURF1Q9HCE7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMURF1Q9HCE7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMURF1Q9HCE7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMURF1Q9HCE7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMURF1Q9HCE7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMURF1Q9HCE7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMURF1Q9HCE7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMURF1Q9HCE7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMURF1Q9HCE7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMURF1Q9HCE7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMURF1Q9HCE7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMURF1Q9HCE7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMURF1Q9HCE7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMURF1Q9HCE7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMURF1Q9HCE7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMURF1Q9HCE7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMURF1Q9HCE7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMURF1Q9HCE7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMURF1Q9HCE7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMURF1Q9HCE7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMURF1Q9HCE7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMURF1Q9HCE7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMURF1Q9HCE7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMURF1Q9HCE7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMURF1Q9HCE7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMURF1Q9HCE7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMURF1Q9HCE7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMURF1Q9HCE7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMURF1Q9HCE7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMURF1Q9HCE7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMURF1Q9HCE7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMURF1Q9HCE7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMURF1Q9HCE7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMURF1Q9HCE7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMURF1Q9HCE7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMURF1Q9HCE7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMURF1Q9HCE7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMURF1Q9HCE7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMURF1Q9HCE7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMURF1Q9HCE7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMURF1Q9HCE7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMURF1Q9HCE7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMURF1Q9HCE7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMURF1Q9HCE7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMURF1Q9HCE7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMURF1Q9HCE7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMURF1Q9HCE7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMURF1Q9HCE7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMURF1Q9HCE7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMURF1Q9HCE7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMURF1Q9HCE7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMURF1Q9HCE7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMURF1Q9HCE7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMURF1Q9HCE7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms