Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABEP2Q9H5N1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RABEP2Q9H5N1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RABEP2Q9H5N1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RABEP2Q9H5N1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABEP2Q9H5N1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABEP2Q9H5N1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABEP2Q9H5N1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABEP2Q9H5N1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABEP2Q9H5N1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RABEP2Q9H5N1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RABEP2Q9H5N1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABEP2Q9H5N1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABEP2Q9H5N1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABEP2Q9H5N1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABEP2Q9H5N1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RABEP2Q9H5N1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RABEP2Q9H5N1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABEP2Q9H5N1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RABEP2Q9H5N1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RABEP2Q9H5N1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABEP2Q9H5N1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RABEP2Q9H5N1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABEP2Q9H5N1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABEP2Q9H5N1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABEP2Q9H5N1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABEP2Q9H5N1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RABEP2Q9H5N1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABEP2Q9H5N1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABEP2Q9H5N1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABEP2Q9H5N1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABEP2Q9H5N1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABEP2Q9H5N1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RABEP2Q9H5N1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RABEP2Q9H5N1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RABEP2Q9H5N1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RABEP2Q9H5N1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABEP2Q9H5N1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABEP2Q9H5N1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABEP2Q9H5N1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABEP2Q9H5N1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RABEP2Q9H5N1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RABEP2Q9H5N1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABEP2Q9H5N1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABEP2Q9H5N1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABEP2Q9H5N1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABEP2Q9H5N1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABEP2Q9H5N1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABEP2Q9H5N1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RABEP2Q9H5N1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RABEP2Q9H5N1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RABEP2Q9H5N1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABEP2Q9H5N1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABEP2Q9H5N1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABEP2Q9H5N1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RABEP2Q9H5N1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABEP2Q9H5N1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABEP2Q9H5N1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RABEP2Q9H5N1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RABEP2Q9H5N1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RABEP2Q9H5N1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABEP2Q9H5N1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABEP2Q9H5N1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABEP2Q9H5N1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABEP2Q9H5N1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABEP2Q9H5N1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABEP2Q9H5N1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABEP2Q9H5N1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABEP2Q9H5N1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABEP2Q9H5N1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RABEP2Q9H5N1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABEP2Q9H5N1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABEP2Q9H5N1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABEP2Q9H5N1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABEP2Q9H5N1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABEP2Q9H5N1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABEP2Q9H5N1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABEP2Q9H5N1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RABEP2Q9H5N1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RABEP2Q9H5N1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RABEP2Q9H5N1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABEP2Q9H5N1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABEP2Q9H5N1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABEP2Q9H5N1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABEP2Q9H5N1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABEP2Q9H5N1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RABEP2Q9H5N1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RABEP2Q9H5N1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RABEP2Q9H5N1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABEP2Q9H5N1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABEP2Q9H5N1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABEP2Q9H5N1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABEP2Q9H5N1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABEP2Q9H5N1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RABEP2Q9H5N1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABEP2Q9H5N1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABEP2Q9H5N1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABEP2Q9H5N1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RABEP2Q9H5N1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RABEP2Q9H5N1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms