Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDCL3Q9H2J4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDCL3Q9H2J4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PDCL3Q9H2J4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDCL3Q9H2J4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PDCL3Q9H2J4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PDCL3Q9H2J4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDCL3Q9H2J4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PDCL3Q9H2J4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PDCL3Q9H2J4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PDCL3Q9H2J4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PDCL3Q9H2J4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDCL3Q9H2J4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDCL3Q9H2J4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDCL3Q9H2J4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDCL3Q9H2J4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDCL3Q9H2J4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDCL3Q9H2J4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDCL3Q9H2J4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDCL3Q9H2J4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDCL3Q9H2J4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDCL3Q9H2J4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDCL3Q9H2J4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDCL3Q9H2J4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PDCL3Q9H2J4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDCL3Q9H2J4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDCL3Q9H2J4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDCL3Q9H2J4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDCL3Q9H2J4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDCL3Q9H2J4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDCL3Q9H2J4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDCL3Q9H2J4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDCL3Q9H2J4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDCL3Q9H2J4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDCL3Q9H2J4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDCL3Q9H2J4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDCL3Q9H2J4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDCL3Q9H2J4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDCL3Q9H2J4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDCL3Q9H2J4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDCL3Q9H2J4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDCL3Q9H2J4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDCL3Q9H2J4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDCL3Q9H2J4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms