Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E2

XPO4, Exportin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPO4Q9C0E2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
XPO4Q9C0E2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
XPO4Q9C0E2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
XPO4Q9C0E2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
XPO4Q9C0E2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
XPO4Q9C0E2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
XPO4Q9C0E2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
XPO4Q9C0E2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
XPO4Q9C0E2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
XPO4Q9C0E2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
XPO4Q9C0E2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
XPO4Q9C0E2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
XPO4Q9C0E2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
XPO4Q9C0E2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
XPO4Q9C0E2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
XPO4Q9C0E2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
XPO4Q9C0E2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
XPO4Q9C0E2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
XPO4Q9C0E2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
XPO4Q9C0E2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
XPO4Q9C0E2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
XPO4Q9C0E2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
XPO4Q9C0E2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
XPO4Q9C0E2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
XPO4Q9C0E2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
XPO4Q9C0E2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
XPO4Q9C0E2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
XPO4Q9C0E2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
XPO4Q9C0E2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
XPO4Q9C0E2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
XPO4Q9C0E2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
XPO4Q9C0E2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
XPO4Q9C0E2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
XPO4Q9C0E2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
XPO4Q9C0E2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
XPO4Q9C0E2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
XPO4Q9C0E2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
XPO4Q9C0E2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
XPO4Q9C0E2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
XPO4Q9C0E2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
XPO4Q9C0E2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
XPO4Q9C0E2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
XPO4Q9C0E2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
XPO4Q9C0E2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
XPO4Q9C0E2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
XPO4Q9C0E2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
XPO4Q9C0E2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
XPO4Q9C0E2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
XPO4Q9C0E2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
XPO4Q9C0E2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
XPO4Q9C0E2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
XPO4Q9C0E2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
XPO4Q9C0E2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
XPO4Q9C0E2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
XPO4Q9C0E2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
XPO4Q9C0E2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
XPO4Q9C0E2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
XPO4Q9C0E2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
XPO4Q9C0E2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
XPO4Q9C0E2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
XPO4Q9C0E2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
XPO4Q9C0E2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
XPO4Q9C0E2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
XPO4Q9C0E2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
XPO4Q9C0E2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
XPO4Q9C0E2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
XPO4Q9C0E2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
XPO4Q9C0E2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
XPO4Q9C0E2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
XPO4Q9C0E2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
XPO4Q9C0E2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
XPO4Q9C0E2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
XPO4Q9C0E2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
XPO4Q9C0E2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
XPO4Q9C0E2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
XPO4Q9C0E2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
XPO4Q9C0E2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
XPO4Q9C0E2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
XPO4Q9C0E2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
XPO4Q9C0E2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPO4Q9C0E2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPO4Q9C0E2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
XPO4Q9C0E2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
XPO4Q9C0E2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
XPO4Q9C0E2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
XPO4Q9C0E2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
XPO4Q9C0E2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
XPO4Q9C0E2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
XPO4Q9C0E2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
XPO4Q9C0E2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
XPO4Q9C0E2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
XPO4Q9C0E2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
XPO4Q9C0E2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
XPO4Q9C0E2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
XPO4Q9C0E2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
XPO4Q9C0E2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
XPO4Q9C0E2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
XPO4Q9C0E2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
XPO4Q9C0E2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
XPO4Q9C0E2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms