Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM4Q9C037 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM4Q9C037 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM4Q9C037 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM4Q9C037 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM4Q9C037 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM4Q9C037 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM4Q9C037 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM4Q9C037 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM4Q9C037 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM4Q9C037 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM4Q9C037 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIM4Q9C037 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM4Q9C037 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM4Q9C037 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM4Q9C037 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM4Q9C037 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM4Q9C037 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM4Q9C037 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM4Q9C037 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM4Q9C037 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM4Q9C037 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM4Q9C037 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM4Q9C037 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM4Q9C037 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM4Q9C037 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM4Q9C037 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM4Q9C037 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM4Q9C037 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM4Q9C037 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM4Q9C037 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM4Q9C037 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM4Q9C037 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM4Q9C037 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM4Q9C037 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM4Q9C037 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM4Q9C037 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM4Q9C037 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM4Q9C037 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM4Q9C037 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM4Q9C037 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM4Q9C037 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM4Q9C037 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM4Q9C037 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM4Q9C037 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM4Q9C037 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM4Q9C037 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM4Q9C037 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM4Q9C037 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM4Q9C037 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM4Q9C037 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM4Q9C037 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM4Q9C037 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM4Q9C037 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM4Q9C037 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM4Q9C037 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM4Q9C037 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM4Q9C037 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM4Q9C037 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM4Q9C037 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM4Q9C037 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM4Q9C037 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM4Q9C037 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM4Q9C037 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM4Q9C037 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM4Q9C037 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM4Q9C037 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM4Q9C037 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM4Q9C037 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM4Q9C037 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM4Q9C037 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM4Q9C037 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM4Q9C037 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM4Q9C037 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM4Q9C037 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM4Q9C037 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM4Q9C037 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM4Q9C037 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM4Q9C037 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM4Q9C037 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM4Q9C037 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM4Q9C037 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM4Q9C037 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM4Q9C037 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM4Q9C037 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM4Q9C037 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM4Q9C037 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM4Q9C037 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM4Q9C037 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM4Q9C037 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM4Q9C037 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM4Q9C037 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM4Q9C037 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM4Q9C037 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM4Q9C037 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM4Q9C037 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM4Q9C037 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM4Q9C037 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM4Q9C037 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM4Q9C037 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms