Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA5

SUCNR1, Succinate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCNR1Q9BXA5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCNR1Q9BXA5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCNR1Q9BXA5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCNR1Q9BXA5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCNR1Q9BXA5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCNR1Q9BXA5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCNR1Q9BXA5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUCNR1Q9BXA5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUCNR1Q9BXA5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUCNR1Q9BXA5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUCNR1Q9BXA5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUCNR1Q9BXA5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUCNR1Q9BXA5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUCNR1Q9BXA5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUCNR1Q9BXA5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUCNR1Q9BXA5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUCNR1Q9BXA5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUCNR1Q9BXA5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUCNR1Q9BXA5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUCNR1Q9BXA5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUCNR1Q9BXA5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUCNR1Q9BXA5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUCNR1Q9BXA5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUCNR1Q9BXA5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCNR1Q9BXA5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCNR1Q9BXA5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCNR1Q9BXA5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCNR1Q9BXA5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCNR1Q9BXA5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCNR1Q9BXA5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUCNR1Q9BXA5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUCNR1Q9BXA5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUCNR1Q9BXA5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUCNR1Q9BXA5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUCNR1Q9BXA5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUCNR1Q9BXA5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUCNR1Q9BXA5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUCNR1Q9BXA5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUCNR1Q9BXA5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUCNR1Q9BXA5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUCNR1Q9BXA5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCNR1Q9BXA5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCNR1Q9BXA5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCNR1Q9BXA5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCNR1Q9BXA5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUCNR1Q9BXA5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCNR1Q9BXA5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCNR1Q9BXA5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SUCNR1Q9BXA5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUCNR1Q9BXA5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUCNR1Q9BXA5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUCNR1Q9BXA5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUCNR1Q9BXA5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUCNR1Q9BXA5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUCNR1Q9BXA5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUCNR1Q9BXA5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUCNR1Q9BXA5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUCNR1Q9BXA5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SUCNR1Q9BXA5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUCNR1Q9BXA5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUCNR1Q9BXA5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUCNR1Q9BXA5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUCNR1Q9BXA5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCNR1Q9BXA5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCNR1Q9BXA5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCNR1Q9BXA5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCNR1Q9BXA5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCNR1Q9BXA5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUCNR1Q9BXA5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUCNR1Q9BXA5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCNR1Q9BXA5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCNR1Q9BXA5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCNR1Q9BXA5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCNR1Q9BXA5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCNR1Q9BXA5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCNR1Q9BXA5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCNR1Q9BXA5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCNR1Q9BXA5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SUCNR1Q9BXA5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SUCNR1Q9BXA5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCNR1Q9BXA5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCNR1Q9BXA5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCNR1Q9BXA5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCNR1Q9BXA5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms