Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS4Q9BT78 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPS4Q9BT78 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS4Q9BT78 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPS4Q9BT78 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPS4Q9BT78 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPS4Q9BT78 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPS4Q9BT78 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS4Q9BT78 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS4Q9BT78 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS4Q9BT78 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS4Q9BT78 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS4Q9BT78 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS4Q9BT78 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS4Q9BT78 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS4Q9BT78 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS4Q9BT78 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS4Q9BT78 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS4Q9BT78 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS4Q9BT78 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS4Q9BT78 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS4Q9BT78 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS4Q9BT78 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS4Q9BT78 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS4Q9BT78 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS4Q9BT78 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS4Q9BT78 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS4Q9BT78 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS4Q9BT78 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS4Q9BT78 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS4Q9BT78 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPS4Q9BT78 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPS4Q9BT78 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPS4Q9BT78 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS4Q9BT78 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPS4Q9BT78 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPS4Q9BT78 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
COPS4Q9BT78 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS4Q9BT78 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS4Q9BT78 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS4Q9BT78 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS4Q9BT78 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS4Q9BT78 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS4Q9BT78 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS4Q9BT78 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPS4Q9BT78 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPS4Q9BT78 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPS4Q9BT78 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPS4Q9BT78 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPS4Q9BT78 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPS4Q9BT78 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS4Q9BT78 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS4Q9BT78 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS4Q9BT78 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS4Q9BT78 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS4Q9BT78 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS4Q9BT78 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS4Q9BT78 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPS4Q9BT78 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPS4Q9BT78 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPS4Q9BT78 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPS4Q9BT78 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS4Q9BT78 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS4Q9BT78 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS4Q9BT78 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPS4Q9BT78 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPS4Q9BT78 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COPS4Q9BT78 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS4Q9BT78 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS4Q9BT78 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS4Q9BT78 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPS4Q9BT78 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPS4Q9BT78 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPS4Q9BT78 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COPS4Q9BT78 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS4Q9BT78 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPS4Q9BT78 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPS4Q9BT78 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPS4Q9BT78 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS4Q9BT78 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS4Q9BT78 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS4Q9BT78 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS4Q9BT78 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS4Q9BT78 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS4Q9BT78 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS4Q9BT78 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS4Q9BT78 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS4Q9BT78 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS4Q9BT78 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS4Q9BT78 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS4Q9BT78 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS4Q9BT78 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS4Q9BT78 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS4Q9BT78 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS4Q9BT78 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS4Q9BT78 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS4Q9BT78 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS4Q9BT78 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS4Q9BT78 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS4Q9BT78 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms