Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VRK1Q99986 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VRK1Q99986 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VRK1Q99986 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VRK1Q99986 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VRK1Q99986 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VRK1Q99986 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VRK1Q99986 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VRK1Q99986 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VRK1Q99986 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VRK1Q99986 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VRK1Q99986 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VRK1Q99986 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VRK1Q99986 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VRK1Q99986 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VRK1Q99986 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VRK1Q99986 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VRK1Q99986 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VRK1Q99986 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VRK1Q99986 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VRK1Q99986 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VRK1Q99986 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VRK1Q99986 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VRK1Q99986 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VRK1Q99986 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VRK1Q99986 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VRK1Q99986 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VRK1Q99986 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VRK1Q99986 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VRK1Q99986 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VRK1Q99986 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VRK1Q99986 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VRK1Q99986 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VRK1Q99986 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VRK1Q99986 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VRK1Q99986 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VRK1Q99986 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VRK1Q99986 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VRK1Q99986 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VRK1Q99986 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VRK1Q99986 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VRK1Q99986 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VRK1Q99986 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VRK1Q99986 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VRK1Q99986 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VRK1Q99986 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VRK1Q99986 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VRK1Q99986 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VRK1Q99986 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VRK1Q99986 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VRK1Q99986 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VRK1Q99986 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VRK1Q99986 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VRK1Q99986 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VRK1Q99986 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VRK1Q99986 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VRK1Q99986 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VRK1Q99986 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VRK1Q99986 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VRK1Q99986 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VRK1Q99986 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VRK1Q99986 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VRK1Q99986 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VRK1Q99986 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VRK1Q99986 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VRK1Q99986 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VRK1Q99986 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VRK1Q99986 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VRK1Q99986 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VRK1Q99986 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VRK1Q99986 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VRK1Q99986 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VRK1Q99986 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VRK1Q99986 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VRK1Q99986 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VRK1Q99986 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VRK1Q99986 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VRK1Q99986 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VRK1Q99986 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VRK1Q99986 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VRK1Q99986 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VRK1Q99986 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VRK1Q99986 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VRK1Q99986 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VRK1Q99986 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VRK1Q99986 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VRK1Q99986 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VRK1Q99986 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VRK1Q99986 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VRK1Q99986 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VRK1Q99986 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VRK1Q99986 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VRK1Q99986 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VRK1Q99986 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VRK1Q99986 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VRK1Q99986 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VRK1Q99986 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VRK1Q99986 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VRK1Q99986 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VRK1Q99986 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms