Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRELID3AQ96N28 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRELID3AQ96N28 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRELID3AQ96N28 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRELID3AQ96N28 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRELID3AQ96N28 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRELID3AQ96N28 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRELID3AQ96N28 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRELID3AQ96N28 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRELID3AQ96N28 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRELID3AQ96N28 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRELID3AQ96N28 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRELID3AQ96N28 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRELID3AQ96N28 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRELID3AQ96N28 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRELID3AQ96N28 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRELID3AQ96N28 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRELID3AQ96N28 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRELID3AQ96N28 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRELID3AQ96N28 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PRELID3AQ96N28 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRELID3AQ96N28 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRELID3AQ96N28 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRELID3AQ96N28 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRELID3AQ96N28 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRELID3AQ96N28 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRELID3AQ96N28 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRELID3AQ96N28 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRELID3AQ96N28 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRELID3AQ96N28 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRELID3AQ96N28 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRELID3AQ96N28 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRELID3AQ96N28 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRELID3AQ96N28 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRELID3AQ96N28 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRELID3AQ96N28 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRELID3AQ96N28 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRELID3AQ96N28 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRELID3AQ96N28 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRELID3AQ96N28 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRELID3AQ96N28 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRELID3AQ96N28 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRELID3AQ96N28 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRELID3AQ96N28 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRELID3AQ96N28 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRELID3AQ96N28 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRELID3AQ96N28 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRELID3AQ96N28 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRELID3AQ96N28 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRELID3AQ96N28 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRELID3AQ96N28 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRELID3AQ96N28 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRELID3AQ96N28 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRELID3AQ96N28 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRELID3AQ96N28 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRELID3AQ96N28 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRELID3AQ96N28 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRELID3AQ96N28 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRELID3AQ96N28 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRELID3AQ96N28 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRELID3AQ96N28 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRELID3AQ96N28 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRELID3AQ96N28 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRELID3AQ96N28 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRELID3AQ96N28 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRELID3AQ96N28 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRELID3AQ96N28 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRELID3AQ96N28 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRELID3AQ96N28 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRELID3AQ96N28 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PRELID3AQ96N28 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3AQ96N28 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRELID3AQ96N28 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRELID3AQ96N28 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRELID3AQ96N28 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PRELID3AQ96N28 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRELID3AQ96N28 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRELID3AQ96N28 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRELID3AQ96N28 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRELID3AQ96N28 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRELID3AQ96N28 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRELID3AQ96N28 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRELID3AQ96N28 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRELID3AQ96N28 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms