Protein–RNA interactions for Protein: Q96MV1

TMEM56, Transmembrane protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM56Q96MV1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM56Q96MV1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM56Q96MV1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM56Q96MV1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM56Q96MV1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM56Q96MV1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM56Q96MV1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM56Q96MV1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM56Q96MV1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM56Q96MV1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM56Q96MV1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM56Q96MV1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM56Q96MV1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM56Q96MV1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM56Q96MV1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM56Q96MV1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM56Q96MV1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM56Q96MV1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM56Q96MV1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM56Q96MV1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM56Q96MV1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM56Q96MV1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM56Q96MV1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM56Q96MV1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM56Q96MV1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM56Q96MV1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM56Q96MV1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM56Q96MV1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM56Q96MV1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM56Q96MV1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM56Q96MV1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM56Q96MV1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM56Q96MV1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM56Q96MV1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM56Q96MV1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM56Q96MV1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM56Q96MV1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM56Q96MV1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM56Q96MV1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM56Q96MV1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM56Q96MV1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM56Q96MV1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM56Q96MV1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM56Q96MV1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM56Q96MV1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM56Q96MV1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM56Q96MV1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM56Q96MV1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM56Q96MV1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM56Q96MV1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM56Q96MV1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM56Q96MV1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM56Q96MV1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM56Q96MV1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM56Q96MV1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM56Q96MV1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM56Q96MV1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM56Q96MV1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM56Q96MV1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM56Q96MV1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM56Q96MV1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM56Q96MV1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM56Q96MV1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM56Q96MV1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM56Q96MV1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM56Q96MV1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM56Q96MV1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM56Q96MV1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM56Q96MV1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM56Q96MV1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM56Q96MV1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM56Q96MV1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM56Q96MV1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM56Q96MV1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM56Q96MV1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM56Q96MV1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM56Q96MV1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM56Q96MV1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM56Q96MV1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM56Q96MV1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM56Q96MV1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM56Q96MV1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM56Q96MV1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM56Q96MV1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM56Q96MV1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM56Q96MV1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM56Q96MV1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM56Q96MV1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM56Q96MV1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM56Q96MV1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM56Q96MV1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM56Q96MV1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM56Q96MV1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM56Q96MV1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM56Q96MV1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM56Q96MV1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM56Q96MV1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM56Q96MV1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM56Q96MV1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM56Q96MV1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms